【第二次巫师战争时期（1995-1998）】

1995年伏地魔复活后，凤凰社重新建立。此时的霍格沃茨与凤凰社之间的关系，与第一次战争时期有了本质的不同。

最大的变化是：邓布利多不再能完全掌控学校。

1995-1996学年，魔法部通过教育令逐步剥夺了邓布利多的权力，最终由多洛雷斯·乌姆里奇接任校长（实际是“高级调查官”行使校长职权）。在这一时期，凤凰社的活动被完全逐出了霍格沃茨。邓布利多军——一个由学生自发组织的抵抗团体——成为了城堡中唯一对抗乌姆里奇的力量，但它不是凤凰社的一部分，尽管它的成立得到了邓布利多的默许，它的核心成员（哈利·波特、赫敏·格兰杰、罗恩·韦斯莱）后来都成为了凤凰社的重要成员。

1996-1997学年，邓布利多恢复校长职位，但伏地魔对魔法世界的控制日益加深。凤凰社与霍格沃茨之间的联系在这一时期变得更加紧密——不是因为邓布利多有意为之，而是因为战线已经推到了城堡门前。霍格沃茨不再仅仅是凤凰社的“支持点”；它本身正在成为前线。

1997年6月邓布利多去世后，霍格沃茨迅速落入伏地魔的控制。凤凰社成员被禁止进入城堡，霍格沃茨成为了敌人占领的领土。直到1998年5月的霍格沃茨战役，凤凰社——此时已与幸存的霍格沃茨师生、霍格莫德村民和魔法部傲罗联合——才重新夺回了城堡。

关于这一时期凤凰社与霍格沃茨之间联系的详细记录，见本书第五卷。

【邓布利多的原则】

纵观邓布利多对“凤凰社-霍格沃茨关系”的处理，有一条原则始终贯穿其中：学校不能被用作战场。

在第一次巫师战争期间，这条原则意味着“不让战争进入城堡”。邓布利多拒绝了不止一次将霍格沃茨设为凤凰社总部的提议，理由很简单：一旦伏地魔将霍格沃茨视为“敌方据点”，他就会把霍格沃茨当作攻击目标。城堡的防护魔法很强，但世界上没有绝对攻不破的堡垒。而城堡一旦成为战场，首先受害的将是那些与战争毫无关系的学生。

在第二次巫师战争期间，这条原则变得更加难以维持。当伏地魔将整个魔法世界视为战场时，“不让战争进入城堡”变成了一种奢望。但即使在最黑暗的时刻——1997-1998学年伏地魔控制学校期间——邓布利多的原则仍在以另一种方式被守护着：那些留在城堡中保护学生的教职工（如米勒娃·麦格、弗立维教授、斯普劳特教授），尽管无力反抗伏地魔的统治，但始终将学生的安全置于首位。

战后，米勒娃·麦格校长在评价邓布利多这一原则时说道：

“有些人认为邓布利多应该在第一次战争期间就把霍格沃茨变成凤凰社的堡垒。他们说他‘浪费了城堡的防御优势’。但霍格沃茨不是一座堡垒——至少，不首先是一座堡垒。它是一所学校。邓布利多从未忘记这一点。这是他与伏地魔最根本的区别。伏地魔把霍格沃茨看作一个需要征服的据点。邓布利多把它看作一个需要保护的地方。同一个城堡，两种完全不同的理解。而历史证明了哪一种理解是对的。”